権太原遺跡（ごんたっぱらいせき)は神奈川県横浜市にある弥生時代の遺跡である。
権太原遺跡は港北ニュータウンの東にあり、大塚遺跡から2km東側にある。 弥生時代中期の環濠集落が廃絶された後、後期初頭から古墳時代前期に至るまで権太原遺跡は小集落として継続した。権太原遺跡で出土した磨製石斧は緑色に輝く石を使い、全体を磨いている。この石斧は長野県榎田遺跡で作られたものであった。 遺跡の中心部が大きく削られており、遺構の残存状況は悪い。環濠は全周700mの隅丸長方形であるが、環濠が全部つながっているかどうかは不明とされる。 しかし、環濠内の面積は3万3000m2であり大塚遺跡周辺の環濠集落では最大となる。環濠の最大幅は4.5m、最大深さは2mである。竪穴住居は34軒あったが、削平がなければより多くの住居が見つかった可能性がある。 南側に隣接する新吉田十三遺跡と矢東遺跡は権太原遺跡の墓域（方形周溝墓群）である。
大塚遺跡の発掘よりあとになる1980年（昭和55年）・1981年（昭和56年）・1985年（昭和60年）・1987年（昭和62年）～1989年（平成元年）に発掘調査された。大型竪穴住居(BH48号住居)は１辺5.8m（33.6m2）である。大きさからすると遺跡のリーダーと思われる。小型竪穴住居（BH4号住居）は1辺2.2mで4.8m2と２坪ないくらいである。 権太原遺跡から出土した土器は宮ノ台式土器であるが、３期を中心とする大塚遺跡とは異なり、３期から５期に渡る。方形周溝墓は遺跡の北側に４４基、南側に２８基検出されているが、当時はこれより多かったとみられる。 周辺遺跡と合わせると長期の土器編年・集落の変遷に貴重な資料を提供している遺跡である。 主体部から碧玉製管玉が出土した墓が２基ある。大塚遺跡では副葬品は出ていないのと対照的である。遺跡の北東端から１辺18mの大型の方形周溝墓が検出された。大塚遺跡の方形周溝墓のサイズと比べると格段に大きい。
権太原遺跡の住居の広さでは最大面積と最小面積の差が約8陪ある。最大面積の住居でも大塚遺跡の最大面積よりは小さい。弥生時代においても、貧富の格差はかなり見られる。 社会保障のない時代なので、水田稲作に関する能力差が貧富の格差に直結したのであろう。集落のリーダーは、村の共同作業を指揮監督したり、祭祀を行ったり、地域防衛の活動をしたりで、取り分が多かったかもしれない。あるいは蓄積した富の配分権もあったかもしれない。弥生時代は格差のなかった縄文時代とは様相が異なる。水田稲作と貧富の格差の発生は関連している。
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